Abstract
Chronic kidney disease (CKD), impairment of kidney function, is a serious public health problem, and the assessment of genetic factors influencing kidney function has substantial clinical relevance. Here, we report a meta-analysis of genome-wide association studies for kidney function-related traits, including 71,149 east Asian individuals from 18 studies in 11 population-, hospital-or family-based cohorts, conducted as part of the Asian Genetic Epidemiology Network (AGEN). Our meta-analysis identified 17 loci newly associated with kidney function-related traits, including the concentrations of blood urea nitrogen, uric acid and serum creatinine and estimated glomerular filtration rate based on serum creatinine levels (eGFRcrea) (P < 5.0 × 10-8). We further examined these loci with in silico replication in individuals of European ancestry from the KidneyGen, CKDGen and GUGC consortia, including a combined total of ∼110,347 individuals. We identify pleiotropic associations among these loci with kidney function-related traits and risk of CKD. These findings provide new insights into the genetics of kidney function.
| Original language | English |
|---|---|
| Pages (from-to) | 904-909 |
| Number of pages | 6 |
| Journal | Nature Genetics |
| Volume | 44 |
| Issue number | 8 |
| DOIs | |
| Publication status | Published - 01-08-2012 |
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- Genetics
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Meta-analysis identifies multiple loci associated with kidney function-related traits in east Asian populations. / Okada, Y.; Sim, X.; Go, M. J. et al.
In: Nature Genetics, Vol. 44, No. 8, 01.08.2012, p. 904-909.Research output: Contribution to journal › Article › peer-review
TY - JOUR
T1 - Meta-analysis identifies multiple loci associated with kidney function-related traits in east Asian populations
AU - Okada, Y.
AU - Sim, X.
AU - Go, M. J.
AU - Wu, J. Y.
AU - Gu, D.
AU - Takeuchi, F.
AU - Takahashi, A.
AU - Maeda, S.
AU - Tsunoda, T.
AU - Chen, P.
AU - Lim, S. C.
AU - Wong, T. Y.
AU - Liu, J.
AU - Young, T. L.
AU - Aung, T.
AU - Seielstad, M.
AU - Teo, Y. Y.
AU - Kim, Y. J.
AU - Lee, J. Y.
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AU - Kang, D.
AU - Chen, C. h.
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AU - Chang, L. c.
AU - Fann, S. j.
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AU - Rao, D. c.
AU - Hixson, J. e.
AU - Chen, S.
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AU - Albrecht, E.
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AU - Kamatani, N.
AU - Kato, N.
AU - He, J.
AU - Chen, Y. t.
AU - Cho, Y. s.
AU - Tai, E. s.
AU - Tanaka, T.
AU - Chambers, J. c.
AU - Zhang, W.
AU - Lord, G. m.
AU - van der Harst, P.
AU - Lawlor, D. a.
AU - Sehmi, J. s.
AU - Gale, D. p.
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AU - Brown, M. j.
AU - Caulfield, M. j.
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AU - Cook, H. t.
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AU - Smith, G. d.
AU - de Silva, R.
AU - Deng, G.
AU - Devuyst, O.
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AU - Dockrell, M.
AU - Dominiczak, A.
AU - Ebrahim, S.
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AU - Floege, J.
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AU - Hepkema, B. g.
AU - Hernandez-Fuentes, M.
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AU - Johnson, T.
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AU - Kleefstra, N.
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AU - Lapsley, M.
AU - Li, Y.
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AU - Luan, J.
AU - Luttropp, K.
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AU - Munroe, P. b.
AU - Nordfors, L.
AU - Parsa, A.
AU - Peltonen, L.
AU - Penninx, B. w.
AU - Perucha, E.
AU - Pouta, A.
AU - Prokopenko, I.
AU - Roderick, P. j.
AU - Ruokonen, A.
AU - Samani, N. j.
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AU - Schalling, M.
AU - Schlessinger, D.
AU - Schlieper, G.
AU - Seelen, M. a.
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AU - Sjögren, M.
AU - Smit, J. h.
AU - Snieder, H.
AU - Soranzo, N.
AU - Spector, T. d.
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AU - Sternberg, M. j.
AU - Swaminathan, R.
AU - Tanaka, T.
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AU - Uda, M.
AU - Vollenweider, P.
AU - Wallace, C.
AU - Waterworth, D.
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AU - Pattaro, C.
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AU - Siscovick, D.
AU - Psaty, B. m.
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AU - Schnabel, R. b.
AU - Wilde, S.
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AU - Leak, T. s.
AU - Illig, T.
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AU - Wichmann, H. e.
AU - Koenig, W.
AU - Zgaga, L.
AU - Zemunik, T.
AU - Kolcic, I.
AU - Minelli, C.
AU - Hu, F. b.
AU - Johansson,
AU - Igl, W.
AU - Zaboli, G.
AU - Wild, S. h.
AU - Wright, A. f.
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AU - Ellinghaus, D.
AU - Schreiber, S.
AU - Aulchenko, Y. s.
AU - Felix, J. f.
AU - Rivadeneira, F.
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AU - Hofman, A.
AU - Imboden, M.
AU - Nitsch, D.
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AU - Kollerits, B.
AU - Kedenko, L.
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AU - Stumvoll, M.
AU - Kovacs, P.
AU - Boban, M.
AU - Campbell, S.
AU - Endlich, K.
AU - Völzke, H.
AU - Kroemer, H. k.
AU - Nauck, M.
AU - Völker, U.
AU - Polasek, O.
AU - Vitart, V.
AU - Badola, S.
AU - Parker, A. n.
AU - Ridker, P. m.
AU - Kardia, S. l.
AU - Blankenberg, S.
AU - Liu, Y.
AU - Curhan, G. c.
AU - Franke, A.
AU - Rochat, T.
AU - Paulweber, B.
AU - Prokopenko, I.
AU - Wang, W.
AU - Gudnason, V.
AU - Shuldiner, A. r.
AU - Coresh, J.
AU - Schmidt, R.
AU - Ferrucci, L.
AU - Shlipak, M. g.
AU - van Duijn, C. m.
AU - Borecki, I.
AU - Krämer, B. k.
AU - Rudan, I.
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AU - Chasman, D. i.
AU - Kao, W. h.
AU - Heid, I. m.
AU - Fox, C. s.
AU - Köttgen, A.
AU - Albrecht, E.
AU - Teumer, A.
AU - Vitart, V.
AU - Krumsiek, J.
AU - Hundertmark, C.
AU - Pistis, G.
AU - Ruggiero, D.
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AU - Haller, T.
AU - Yang, Q.
AU - Tanaka, T.
AU - Johnson, A. d.
AU - Kutalik, Z.
AU - Smith, A. v.
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AU - Struchalin, M.
AU - Middelberg, P. s.
AU - Brown, M. j.
AU - Gaffo, A. l.
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AU - Li, G.
AU - Hayward, C.
AU - Zemunik, T.
AU - Huffman, J.
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AU - Demirkan, A.
AU - Feitosa, M. f.
AU - Liu, X.
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AU - Li, X.
AU - Kleber, M. e.
AU - Hicks, A. a.
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AU - Johansson, A.
AU - Murgia, F.
AU - Wild, S. h.
AU - Bakker, S. j.
AU - Peden, J. f.
AU - Dehghan, A.
AU - Steri, M.
AU - Tenesa, A.
AU - Lagou, V.
AU - Salo, P.
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AU - Tin, A.
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AU - Oldmeadow, C.
AU - Putku, M.
AU - Czamara, D.
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AU - Grotevendt, A.
AU - Gislason, G. k.
AU - Harris, T. b.
AU - Launer, L. j.
AU - McArdle, P.
AU - Shuldiner, A. r.
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AU - Schallert, M.
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AU - Tanaka, T.
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AU - Liu, K.
AU - D'adamo, P.
AU - Ulivi, S.
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AU - Vollenweider, P.
AU - Waeber, G.
AU - Campbell, S.
AU - Devuyst, O.
AU - Navaro, P.
AU - Kolcic, I.
AU - Hastie, N.
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AU - Froguel, P.
AU - Esko, T.
AU - Salumets, A.
AU - Khaw, K. t.
AU - Langenberg, C.
AU - Wareham, N. j.
AU - Isaacs, A.
AU - Kraja, A.
AU - Zhang, Q.
AU - Wild, P. s.
AU - Scott, R. j.
AU - Holliday, E. g.
AU - Org, E.
AU - Viigimaa, M.
AU - Bandinelli, S.
AU - Metter, J. e.
AU - Lupo, A.
AU - Trabetti, E.
AU - Sorice, R.
AU - Döring, A.
AU - Lattka, E.
AU - Strauch, K.
AU - Theis, F.
AU - Waldenberger, M.
AU - Wichmann, H. e.
AU - Davies, G.
AU - Gow, A. j.
AU - Bruinenberg, M.
AU - Stolk, R. p.
AU - Kooner, J. s.
AU - Zhang, W.
AU - Winkelmann, B. r.
AU - Boehm, B. o.
AU - Lucae, S.
AU - Penninx, B. w.
AU - Smit, J. h.
AU - Curhan, G.
AU - Mudgal, P.
AU - Plenge, R. m.
AU - Portas, L.
AU - Persico, I.
AU - Kirin, M.
AU - Wilson, J. f.
AU - Mateo Leach, I.
AU - van Gilst, W. h.
AU - Goel, A.
AU - Ongen, H.
AU - Hofman, A.
AU - Rivadeneira, F.
AU - Uitterlinden, A. g.
AU - Imboden, M.
AU - von Eckardstein, A.
AU - Cucca, Francesco
AU - Nagaraja, R.
AU - Piras, M. g.
AU - Nauck, M.
AU - Schurmann, C.
AU - Budde, K.
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AU - Theodoratou, E.
AU - Prokopenko, I.
AU - Stumvoll, M.
AU - Jula, A.
AU - Perola, M.
AU - Salomaa, V.
AU - Shin, S. y.
AU - Spector, T. d.
AU - Sala, C.
AU - Ridker, P. m.
AU - Kähönen, M.
AU - Viikari, J.
AU - Hengstenberg, C.
AU - Nelson, C. p.
AU - Meschia, J. f.
AU - Nalls, M. a.
AU - Sharma, P.
AU - Singleton, A. b.
AU - Kamatani, N.
AU - Zeller, T.
AU - Burnier, M.
AU - Attia, J.
AU - Laan, M.
AU - Klopp, N.
AU - Hillege, H. l.
AU - Kloiber, S.
AU - Choi, H.
AU - Pirastu, M.
AU - Tore, S.
AU - Probst-Hensch, N. m.
AU - Völzke, H.
AU - Gudnason, V.
AU - Parsa, A.
AU - Schmidt, R.
AU - Whitfield, J. b.
AU - Fornage, M.
AU - Gasparini, P.
AU - Siscovick, D. s.
AU - Polasek, O.
AU - Campbell, H.
AU - Rudan, I.
AU - Bouatia-Naji, N.
AU - Metspalu, A.
AU - Loos, R. j.
AU - van Duijn, C. m.
AU - Borecki, I. b.
AU - Ferrucci, L.
AU - Gambaro, G.
AU - Deary, I. j.
AU - Wolffenbuttel, B. h.
AU - Chambers, J. c.
AU - März, W.
AU - Pramstaller, P. p.
AU - Snieder, H.
AU - Gyllensten, U.
AU - Wright, A. f.
AU - Navis, G.
AU - Watkins, H.
AU - Witteman, J. c.
AU - Sanna, S.
AU - Schipf, S.
AU - Dunlop, M. g.
AU - Tönjes, A.
AU - Ripatti, S.
AU - Soranzo, N.
AU - Toniolo, D.
AU - Chasman, D. i.
AU - Raitakari, O.
AU - Kao, W. h.
AU - Ciullo, M.
AU - Fox, C. s.
AU - Caulfield, M.
AU - Bochud, M.
AU - Gieger, C.
PY - 2012/8/1
Y1 - 2012/8/1
N2 - Chronic kidney disease (CKD), impairment of kidney function, is a serious public health problem, and the assessment of genetic factors influencing kidney function has substantial clinical relevance. Here, we report a meta-analysis of genome-wide association studies for kidney function-related traits, including 71,149 east Asian individuals from 18 studies in 11 population-, hospital-or family-based cohorts, conducted as part of the Asian Genetic Epidemiology Network (AGEN). Our meta-analysis identified 17 loci newly associated with kidney function-related traits, including the concentrations of blood urea nitrogen, uric acid and serum creatinine and estimated glomerular filtration rate based on serum creatinine levels (eGFRcrea) (P < 5.0 × 10-8). We further examined these loci with in silico replication in individuals of European ancestry from the KidneyGen, CKDGen and GUGC consortia, including a combined total of ∼110,347 individuals. We identify pleiotropic associations among these loci with kidney function-related traits and risk of CKD. These findings provide new insights into the genetics of kidney function.
AB - Chronic kidney disease (CKD), impairment of kidney function, is a serious public health problem, and the assessment of genetic factors influencing kidney function has substantial clinical relevance. Here, we report a meta-analysis of genome-wide association studies for kidney function-related traits, including 71,149 east Asian individuals from 18 studies in 11 population-, hospital-or family-based cohorts, conducted as part of the Asian Genetic Epidemiology Network (AGEN). Our meta-analysis identified 17 loci newly associated with kidney function-related traits, including the concentrations of blood urea nitrogen, uric acid and serum creatinine and estimated glomerular filtration rate based on serum creatinine levels (eGFRcrea) (P < 5.0 × 10-8). We further examined these loci with in silico replication in individuals of European ancestry from the KidneyGen, CKDGen and GUGC consortia, including a combined total of ∼110,347 individuals. We identify pleiotropic associations among these loci with kidney function-related traits and risk of CKD. These findings provide new insights into the genetics of kidney function.
UR - http://www.scopus.com/inward/record.url?scp=84864413706&partnerID=8YFLogxK
UR - http://www.scopus.com/inward/citedby.url?scp=84864413706&partnerID=8YFLogxK
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M3 - Article
C2 - 22797727
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SN - 1061-4036
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